Según el Panhispánico, en las construcciones hacer presente y tener presente el adjetivo presente deberá concordar en número con el sustantivo al que se refiere, es decir, el complemento directo de hacer y tener. Por ejemplo:
*Teniendo presente los grandes avances hechos por su país....
Forma adecuada:
Teniendo presentes los grandes avances hechos por su país...
Fuente:
http://buscon.rae.es/dpdI/SrvltConsulta?lema=presente